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常見的染色體拷貝數變異(Copy number variation, CNV)

15q11.2 BP1-BP2 微小片段缺失

在創源實驗室的統計中,這樣的片段缺失,發生率約1/400(25/10,377), 值得注意的是,約7成遺傳自父母(無症狀帶因者)。帶因者者下一胎有約50%的機率,會再生下相同基因型的小孩( Lin et al., 2020)。

此CNV位於15號染色體長臂q11.2區域,位於人類基因體定序hg 19版本中15號染色體鹼基22,770,421到23,214,655的位置,以下稱為「15q11.2微片段」,含有 TUBGCP5、CYFIP1、NIPA2、NIPA1 四個基因。

此CNV座落於人類基因體變異資料庫(Database of Genomic Variants, DGV)好發染色體片段缺失或擴增的區域內,稱為神經易感性位點(neuro-susceptibility loci)。意指帶有這個微片段缺失的人有較高的風險產生神經發育障礙的問題。依據文獻指出在微陣列晶片技術分析下,一般族群(general population)帶有此CNV的盛行率為1/400 (0.25%),而有臨床症狀者(affected)帶此CNV的盛行率介於1/175~1/79 (0.57%~1.27%),約為一般族群的2~4倍(Butler, 2017)。

15q11.2 BP1-BP2微片段缺失的臨床意義尚未十分明確。臨床表現具多變性(variable expressivity),從沒有症狀、輕微到嚴重的症狀都有。最主要的表現為發育遲緩與語言發育遲緩,其他的症狀則包括行為障礙、外觀異常、先天性異常及智能障礙等 (Doornbos et al., 2009; Burnside et al., 2011; Cafferkey et al., 2014; Cox et al., 2015; Butler, 2017)。

由於15q11.2微片段缺失具有不完全外顯率(incomplete penetrance)的特性,意即帶有此微片段缺失者並不一定會有臨床症狀。根據文獻指出15q11.2微片段缺失的外顯率為10.4% (Rosenfeld et al., 2013),意謂 10.4%帶有微片段缺失者會表現出臨床症狀。

參考資料:
1. Lin YH等。在單個實驗室中用染色體微陣列檢測10 377例妊娠中的拷貝數變異。Acta Obstet Gynecol掃描。2020; 99:775-82。
2. Doornbos M等。九名患者在Prader-Willi臨界區的斷點1和2之間存在微缺失15q11.2,可能與行為障礙有關。Eur J Med Genet。2009; 52:108-15。
3. Burnside RD等。BP1和BP2之間的近端15q11.2的微缺失/微複製:神經系統功能障礙的易感區域,包括發育和語言延遲。哼哼 2011; 130:517-28。
4. Rosenfeld JA等。復發性致病拷貝數變異的外顯率估計。基因醫學。2013; 15:478-81。
5. Cafferkey M等。15q11.2(BP1-BP2)缺失患者的表型特徵:進一步描述了一種新出現的綜合徵。Am J Med Genet A.2014; 164A:1916-22。
6.Cox DM等。15q11.2 BP1-BP2微缺失綜合徵:綜述。國際分子科學雜誌。2015; 16:4068-82。